众所周知3A的游戏一向通关后才是真正的开始，这次《生存档案》也不例外，通关后的要素相当丰富。首先在一周目完成任意一个结局后，会提示保存通关存档，返回主界面就会出现“NEW GAME PLUS”，读取刚刚的存档就能开始二周目。
二周目会继承之前通关时的角色等级，技能学习程度，所有的武器，装备和消耗品。
好感度也会继承，但是要注意迷宫探索度和存在结晶不会继承，同时商店会开放新的道具可供购买。
追加新的速跑挑战
新要素方面追加所有迷宫的高级版本，同时开放隐藏迷宫“塔的最深处”，有无全新剧情暂时无法确定。不过会出现各种全新的强力装备，二周目依旧可以愉快的刷刷刷。
